Предметом деятельности Филиала является осуществление прикладных научных исследований в области обеспечения экологической безопасности ракетно-космической деятельности на территории Республики Казахстан. Целью деятельности Филиала является оценка, прогнозирование и разработка рекомендаций по снижению негативного воздействия ракетно-космической деятельности на состояние окружающей среды и здоровья населения Республики Казахстан.